Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprbB2RU80 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.4 ms