Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV32

Arpc1b, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc1bQ9WV32 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Arpc1bQ9WV32 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Arpc1bQ9WV32 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arpc1bQ9WV32 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arpc1bQ9WV32 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arpc1bQ9WV32 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arpc1bQ9WV32 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arpc1bQ9WV32 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arpc1bQ9WV32 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arpc1bQ9WV32 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arpc1bQ9WV32 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arpc1bQ9WV32 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arpc1bQ9WV32 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arpc1bQ9WV32 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arpc1bQ9WV32 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arpc1bQ9WV32 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arpc1bQ9WV32 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arpc1bQ9WV32 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arpc1bQ9WV32 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arpc1bQ9WV32 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arpc1bQ9WV32 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arpc1bQ9WV32 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arpc1bQ9WV32 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arpc1bQ9WV32 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arpc1bQ9WV32 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Arpc1bQ9WV32 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arpc1bQ9WV32 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arpc1bQ9WV32 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arpc1bQ9WV32 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arpc1bQ9WV32 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arpc1bQ9WV32 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arpc1bQ9WV32 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arpc1bQ9WV32 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arpc1bQ9WV32 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arpc1bQ9WV32 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arpc1bQ9WV32 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arpc1bQ9WV32 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arpc1bQ9WV32 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arpc1bQ9WV32 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arpc1bQ9WV32 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms