Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cited4Q9WUL8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cited4Q9WUL8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms