Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpv2Q9WTR1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms