Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lsm4Q9QXA5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms