Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hmgn5Q9JL35 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
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