Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gpa33Q9JKA5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gpa33Q9JKA5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gpa33Q9JKA5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gpa33Q9JKA5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpa33Q9JKA5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpa33Q9JKA5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpa33Q9JKA5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpa33Q9JKA5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpa33Q9JKA5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpa33Q9JKA5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpa33Q9JKA5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpa33Q9JKA5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpa33Q9JKA5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpa33Q9JKA5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpa33Q9JKA5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpa33Q9JKA5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms