Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl28Q9JIL2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 819 ms