Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Subh2bvQ9D9Z7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Subh2bvQ9D9Z7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Subh2bvQ9D9Z7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Subh2bvQ9D9Z7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Subh2bvQ9D9Z7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Subh2bvQ9D9Z7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms