Protein–RNA interactions for Protein: Q9D746

2310034C09Rik, RIKEN cDNA 2310034C09, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310034C09RikQ9D746 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
2310034C09RikQ9D746 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
2310034C09RikQ9D746 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
2310034C09RikQ9D746 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
2310034C09RikQ9D746 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
2310034C09RikQ9D746 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
2310034C09RikQ9D746 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
2310034C09RikQ9D746 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
2310034C09RikQ9D746 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
2310034C09RikQ9D746 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
2310034C09RikQ9D746 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
2310034C09RikQ9D746 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
2310034C09RikQ9D746 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
2310034C09RikQ9D746 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
2310034C09RikQ9D746 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
2310034C09RikQ9D746 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
2310034C09RikQ9D746 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms