Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D5Q8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D5Q8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D5Q8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D5Q8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D5Q8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D5Q8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D5Q8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D5Q8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D5Q8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D5Q8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D5Q8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D5Q8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D5Q8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D5Q8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D5Q8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D5Q8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D5Q8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D5Q8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D5Q8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D5Q8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D5Q8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D5Q8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D5Q8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D5Q8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D5Q8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D5Q8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D5Q8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D5Q8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9D5Q8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9D5Q8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9D5Q8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9D5Q8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9D5Q8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9D5Q8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9D5Q8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9D5Q8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9D5Q8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9D5Q8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9D5Q8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9D5Q8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9D5Q8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9D5Q8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9D5Q8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9D5Q8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9D5Q8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9D5Q8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9D5Q8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q9D5Q8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q9D5Q8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q9D5Q8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q9D5Q8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q9D5Q8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D5Q8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D5Q8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D5Q8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D5Q8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D5Q8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D5Q8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D5Q8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D5Q8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D5Q8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D5Q8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D5Q8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D5Q8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D5Q8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D5Q8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D5Q8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D5Q8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D5Q8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D5Q8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9D5Q8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9D5Q8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9D5Q8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9D5Q8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9D5Q8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9D5Q8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9D5Q8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9D5Q8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9D5Q8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9D5Q8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9D5Q8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9D5Q8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9D5Q8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9D5Q8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9D5Q8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9D5Q8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9D5Q8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9D5Q8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9D5Q8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9D5Q8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9D5Q8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9D5Q8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9D5Q8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9D5Q8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9D5Q8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9D5Q8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9D5Q8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9D5Q8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9D5Q8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms