Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3J9

Uncharacterized protein CXorf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D3J9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D3J9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D3J9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9D3J9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9D3J9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D3J9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D3J9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D3J9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D3J9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D3J9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D3J9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms