Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ20

Mid1ip1, Mid1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1ip1Q9CQ20 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mid1ip1Q9CQ20 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms