Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

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Length 148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
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Mrpl27Q99N92 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl27Q99N92 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl27Q99N92 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl27Q99N92 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl27Q99N92 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl27Q99N92 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl27Q99N92 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Mrpl27Q99N92 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Mrpl27Q99N92 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl27Q99N92 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl27Q99N92 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Mrpl27Q99N92 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl27Q99N92 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl27Q99N92 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Mrpl27Q99N92 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl27Q99N92 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Mrpl27Q99N92 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Mrpl27Q99N92 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl27Q99N92 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl27Q99N92 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl27Q99N92 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Mrpl27Q99N92 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl27Q99N92 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl27Q99N92 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl27Q99N92 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl27Q99N92 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl27Q99N92 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Mrpl27Q99N92 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl27Q99N92 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl27Q99N92 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl27Q99N92 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl27Q99N92 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl27Q99N92 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl27Q99N92 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl27Q99N92 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl27Q99N92 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl27Q99N92 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl27Q99N92 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl27Q99N92 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl27Q99N92 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl27Q99N92 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl27Q99N92 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl27Q99N92 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl27Q99N92 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl27Q99N92 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl27Q99N92 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl27Q99N92 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl27Q99N92 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl27Q99N92 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl27Q99N92 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl27Q99N92 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl27Q99N92 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl27Q99N92 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl27Q99N92 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl27Q99N92 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl27Q99N92 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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