Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Gps1Q99LD4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gps1Q99LD4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gps1Q99LD4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gps1Q99LD4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gps1Q99LD4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gps1Q99LD4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gps1Q99LD4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Gps1Q99LD4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms