Protein–RNA interactions for Protein: Q91VU1

Yipf1, Protein YIPF1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf1Q91VU1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Yipf1Q91VU1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Yipf1Q91VU1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Yipf1Q91VU1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Yipf1Q91VU1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Yipf1Q91VU1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Yipf1Q91VU1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Yipf1Q91VU1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Yipf1Q91VU1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Yipf1Q91VU1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Yipf1Q91VU1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Yipf1Q91VU1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Yipf1Q91VU1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Yipf1Q91VU1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Yipf1Q91VU1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Yipf1Q91VU1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Yipf1Q91VU1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Yipf1Q91VU1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Yipf1Q91VU1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Yipf1Q91VU1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Yipf1Q91VU1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Yipf1Q91VU1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Yipf1Q91VU1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Yipf1Q91VU1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Yipf1Q91VU1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Yipf1Q91VU1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Yipf1Q91VU1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 379.7 ms