Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smg8Q8VE18 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smg8Q8VE18 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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