Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM1

Atad2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2Q8CDM1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atad2Q8CDM1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atad2Q8CDM1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atad2Q8CDM1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atad2Q8CDM1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atad2Q8CDM1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atad2Q8CDM1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atad2Q8CDM1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atad2Q8CDM1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms