Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8B0

Alx1, ALX homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx1Q8C8B0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Alx1Q8C8B0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Alx1Q8C8B0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms