Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP86

Snapc4, snRNA-activating protein complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc4Q8BP86 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snapc4Q8BP86 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snapc4Q8BP86 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snapc4Q8BP86 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snapc4Q8BP86 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snapc4Q8BP86 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snapc4Q8BP86 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snapc4Q8BP86 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snapc4Q8BP86 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snapc4Q8BP86 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snapc4Q8BP86 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snapc4Q8BP86 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snapc4Q8BP86 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snapc4Q8BP86 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snapc4Q8BP86 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snapc4Q8BP86 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snapc4Q8BP86 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snapc4Q8BP86 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Snapc4Q8BP86 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Snapc4Q8BP86 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Snapc4Q8BP86 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Snapc4Q8BP86 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Snapc4Q8BP86 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Snapc4Q8BP86 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Snapc4Q8BP86 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Snapc4Q8BP86 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snapc4Q8BP86 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snapc4Q8BP86 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snapc4Q8BP86 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snapc4Q8BP86 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Snapc4Q8BP86 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snapc4Q8BP86 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snapc4Q8BP86 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snapc4Q8BP86 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snapc4Q8BP86 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snapc4Q8BP86 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snapc4Q8BP86 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snapc4Q8BP86 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snapc4Q8BP86 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snapc4Q8BP86 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snapc4Q8BP86 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snapc4Q8BP86 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snapc4Q8BP86 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Snapc4Q8BP86 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Snapc4Q8BP86 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snapc4Q8BP86 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snapc4Q8BP86 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snapc4Q8BP86 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snapc4Q8BP86 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snapc4Q8BP86 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snapc4Q8BP86 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snapc4Q8BP86 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snapc4Q8BP86 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snapc4Q8BP86 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snapc4Q8BP86 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snapc4Q8BP86 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snapc4Q8BP86 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Snapc4Q8BP86 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snapc4Q8BP86 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snapc4Q8BP86 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snapc4Q8BP86 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snapc4Q8BP86 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snapc4Q8BP86 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snapc4Q8BP86 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snapc4Q8BP86 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snapc4Q8BP86 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snapc4Q8BP86 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snapc4Q8BP86 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snapc4Q8BP86 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snapc4Q8BP86 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snapc4Q8BP86 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Snapc4Q8BP86 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snapc4Q8BP86 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snapc4Q8BP86 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snapc4Q8BP86 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snapc4Q8BP86 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snapc4Q8BP86 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snapc4Q8BP86 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Snapc4Q8BP86 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Snapc4Q8BP86 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Snapc4Q8BP86 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Snapc4Q8BP86 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snapc4Q8BP86 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snapc4Q8BP86 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snapc4Q8BP86 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snapc4Q8BP86 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Snapc4Q8BP86 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snapc4Q8BP86 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snapc4Q8BP86 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snapc4Q8BP86 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snapc4Q8BP86 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snapc4Q8BP86 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snapc4Q8BP86 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snapc4Q8BP86 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snapc4Q8BP86 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Snapc4Q8BP86 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snapc4Q8BP86 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snapc4Q8BP86 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snapc4Q8BP86 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snapc4Q8BP86 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms