Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR6

Syne1, Nesprin-1, mousemouse

Predictions only

Length 8,799 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne1Q6ZWR6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Syne1Q6ZWR6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Syne1Q6ZWR6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Syne1Q6ZWR6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Syne1Q6ZWR6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Syne1Q6ZWR6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Syne1Q6ZWR6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Syne1Q6ZWR6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Syne1Q6ZWR6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Syne1Q6ZWR6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Syne1Q6ZWR6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Syne1Q6ZWR6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Syne1Q6ZWR6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Syne1Q6ZWR6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Syne1Q6ZWR6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Syne1Q6ZWR6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Syne1Q6ZWR6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Syne1Q6ZWR6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Syne1Q6ZWR6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Syne1Q6ZWR6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Syne1Q6ZWR6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Syne1Q6ZWR6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Syne1Q6ZWR6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Syne1Q6ZWR6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Syne1Q6ZWR6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Syne1Q6ZWR6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Syne1Q6ZWR6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Syne1Q6ZWR6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Syne1Q6ZWR6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Syne1Q6ZWR6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Syne1Q6ZWR6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Syne1Q6ZWR6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Syne1Q6ZWR6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Syne1Q6ZWR6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Syne1Q6ZWR6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Syne1Q6ZWR6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Syne1Q6ZWR6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Syne1Q6ZWR6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Syne1Q6ZWR6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Syne1Q6ZWR6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Syne1Q6ZWR6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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