Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NipblQ6KCD5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NipblQ6KCD5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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