Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Knl1Q66JQ7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Knl1Q66JQ7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Knl1Q66JQ7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Knl1Q66JQ7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Knl1Q66JQ7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Knl1Q66JQ7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Knl1Q66JQ7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Knl1Q66JQ7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Knl1Q66JQ7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Knl1Q66JQ7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Knl1Q66JQ7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Knl1Q66JQ7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Knl1Q66JQ7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Knl1Q66JQ7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Knl1Q66JQ7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Knl1Q66JQ7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Knl1Q66JQ7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Knl1Q66JQ7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Knl1Q66JQ7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Knl1Q66JQ7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Knl1Q66JQ7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Knl1Q66JQ7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Knl1Q66JQ7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Knl1Q66JQ7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Knl1Q66JQ7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Knl1Q66JQ7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Knl1Q66JQ7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Knl1Q66JQ7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Knl1Q66JQ7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Knl1Q66JQ7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Knl1Q66JQ7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Knl1Q66JQ7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Knl1Q66JQ7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Knl1Q66JQ7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Knl1Q66JQ7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Knl1Q66JQ7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Knl1Q66JQ7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Knl1Q66JQ7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms