Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc125Q5U465 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc125Q5U465 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc125Q5U465 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc125Q5U465 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc125Q5U465 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc125Q5U465 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc125Q5U465 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc125Q5U465 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc125Q5U465 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc125Q5U465 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc125Q5U465 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc125Q5U465 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc125Q5U465 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc125Q5U465 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc125Q5U465 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc125Q5U465 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc125Q5U465 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc125Q5U465 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc125Q5U465 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc125Q5U465 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc125Q5U465 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc125Q5U465 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc125Q5U465 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc125Q5U465 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc125Q5U465 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc125Q5U465 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc125Q5U465 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc125Q5U465 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc125Q5U465 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc125Q5U465 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc125Q5U465 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc125Q5U465 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc125Q5U465 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc125Q5U465 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc125Q5U465 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc125Q5U465 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc125Q5U465 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 258.7 ms