Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M1

Gm906, Gene model 906, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm906Q3V0M1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm906Q3V0M1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm906Q3V0M1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm906Q3V0M1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm906Q3V0M1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm906Q3V0M1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm906Q3V0M1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm906Q3V0M1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm906Q3V0M1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm906Q3V0M1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm906Q3V0M1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms