Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI43

Babam1, BRISC and BRCA1-A complex member 1, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Babam1Q3UI43 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Babam1Q3UI43 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Babam1Q3UI43 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.5 ms