Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ulk3Q3U3Q1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ulk3Q3U3Q1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms