Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc10Q3TLI0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc10Q3TLI0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms