Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MitfQ08874 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MitfQ08874 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MitfQ08874 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MitfQ08874 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MitfQ08874 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MitfQ08874 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MitfQ08874 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MitfQ08874 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MitfQ08874 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MitfQ08874 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms