Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pfdn6Q03958 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pfdn6Q03958 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pfdn6Q03958 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pfdn6Q03958 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pfdn6Q03958 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pfdn6Q03958 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Pfdn6Q03958 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pfdn6Q03958 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pfdn6Q03958 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pfdn6Q03958 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pfdn6Q03958 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms