Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmklr1P97468 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmklr1P97468 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmklr1P97468 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmklr1P97468 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmklr1P97468 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmklr1P97468 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmklr1P97468 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmklr1P97468 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmklr1P97468 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmklr1P97468 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cmklr1P97468 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms