Protein–RNA interactions for Protein: P46660

Ina, Alpha-internexin, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InaP46660 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
InaP46660 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
InaP46660 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
InaP46660 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
InaP46660 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
InaP46660 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
InaP46660 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
InaP46660 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
InaP46660 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
InaP46660 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
InaP46660 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
InaP46660 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
InaP46660 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
InaP46660 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
InaP46660 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
InaP46660 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
InaP46660 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
InaP46660 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
InaP46660 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
InaP46660 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
InaP46660 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
InaP46660 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
InaP46660 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
InaP46660 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
InaP46660 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
InaP46660 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
InaP46660 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
InaP46660 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
InaP46660 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
InaP46660 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
InaP46660 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
InaP46660 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
InaP46660 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
InaP46660 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
InaP46660 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
InaP46660 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
InaP46660 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
InaP46660 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
InaP46660 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
InaP46660 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
InaP46660 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
InaP46660 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
InaP46660 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
InaP46660 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
InaP46660 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
InaP46660 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
InaP46660 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
InaP46660 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
InaP46660 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
InaP46660 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
InaP46660 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
InaP46660 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
InaP46660 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
InaP46660 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
InaP46660 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
InaP46660 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
InaP46660 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
InaP46660 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
InaP46660 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
InaP46660 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
InaP46660 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
InaP46660 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
InaP46660 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
InaP46660 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
InaP46660 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
InaP46660 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
InaP46660 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
InaP46660 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
InaP46660 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
InaP46660 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
InaP46660 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
InaP46660 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
InaP46660 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
InaP46660 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
InaP46660 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
InaP46660 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
InaP46660 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
InaP46660 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
InaP46660 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
InaP46660 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
InaP46660 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
InaP46660 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
InaP46660 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
InaP46660 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
InaP46660 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
InaP46660 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
InaP46660 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
InaP46660 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
InaP46660 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
InaP46660 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
InaP46660 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
InaP46660 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
InaP46660 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
InaP46660 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
InaP46660 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
InaP46660 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
InaP46660 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
InaP46660 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
InaP46660 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
InaP46660 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms