Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm5cP41230 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm5cP41230 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm5cP41230 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm5cP41230 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm5cP41230 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm5cP41230 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm5cP41230 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm5cP41230 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kdm5cP41230 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kdm5cP41230 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kdm5cP41230 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Kdm5cP41230 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kdm5cP41230 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kdm5cP41230 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Kdm5cP41230 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kdm5cP41230 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm5cP41230 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm5cP41230 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm5cP41230 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm5cP41230 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm5cP41230 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm5cP41230 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm5cP41230 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm5cP41230 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm5cP41230 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm5cP41230 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm5cP41230 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm5cP41230 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm5cP41230 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm5cP41230 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm5cP41230 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm5cP41230 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm5cP41230 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm5cP41230 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm5cP41230 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm5cP41230 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm5cP41230 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm5cP41230 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm5cP41230 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm5cP41230 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm5cP41230 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm5cP41230 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm5cP41230 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm5cP41230 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Kdm5cP41230 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Kdm5cP41230 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kdm5cP41230 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kdm5cP41230 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kdm5cP41230 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Kdm5cP41230 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kdm5cP41230 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kdm5cP41230 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kdm5cP41230 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm5cP41230 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm5cP41230 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm5cP41230 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm5cP41230 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Kdm5cP41230 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm5cP41230 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm5cP41230 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm5cP41230 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm5cP41230 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm5cP41230 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm5cP41230 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm5cP41230 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm5cP41230 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm5cP41230 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm5cP41230 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm5cP41230 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm5cP41230 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm5cP41230 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm5cP41230 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm5cP41230 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm5cP41230 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm5cP41230 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm5cP41230 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm5cP41230 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm5cP41230 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm5cP41230 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm5cP41230 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm5cP41230 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm5cP41230 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm5cP41230 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm5cP41230 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm5cP41230 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm5cP41230 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm5cP41230 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm5cP41230 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm5cP41230 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm5cP41230 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm5cP41230 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm5cP41230 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm5cP41230 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm5cP41230 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm5cP41230 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm5cP41230 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm5cP41230 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Kdm5cP41230 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Kdm5cP41230 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms