Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Kif3aP28741 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kif3aP28741 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms