Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psmb9P28076 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb9P28076 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms