Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spi1P17433 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spi1P17433 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spi1P17433 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spi1P17433 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spi1P17433 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spi1P17433 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spi1P17433 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spi1P17433 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms