Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RhoP15409 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RhoP15409 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RhoP15409 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RhoP15409 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RhoP15409 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RhoP15409 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RhoP15409 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RhoP15409 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RhoP15409 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
RhoP15409 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RhoP15409 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RhoP15409 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RhoP15409 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RhoP15409 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RhoP15409 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RhoP15409 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RhoP15409 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RhoP15409 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RhoP15409 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RhoP15409 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RhoP15409 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RhoP15409 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RhoP15409 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RhoP15409 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RhoP15409 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RhoP15409 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RhoP15409 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RhoP15409 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RhoP15409 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RhoP15409 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RhoP15409 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RhoP15409 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RhoP15409 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RhoP15409 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RhoP15409 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RhoP15409 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RhoP15409 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RhoP15409 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RhoP15409 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RhoP15409 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RhoP15409 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RhoP15409 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RhoP15409 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RhoP15409 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RhoP15409 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RhoP15409 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RhoP15409 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RhoP15409 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RhoP15409 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RhoP15409 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RhoP15409 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RhoP15409 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RhoP15409 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RhoP15409 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RhoP15409 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RhoP15409 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RhoP15409 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RhoP15409 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RhoP15409 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RhoP15409 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RhoP15409 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RhoP15409 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RhoP15409 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RhoP15409 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RhoP15409 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RhoP15409 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RhoP15409 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RhoP15409 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RhoP15409 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RhoP15409 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RhoP15409 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RhoP15409 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RhoP15409 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RhoP15409 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RhoP15409 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RhoP15409 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RhoP15409 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RhoP15409 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RhoP15409 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RhoP15409 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RhoP15409 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RhoP15409 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RhoP15409 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RhoP15409 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RhoP15409 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RhoP15409 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RhoP15409 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RhoP15409 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RhoP15409 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RhoP15409 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RhoP15409 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RhoP15409 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RhoP15409 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RhoP15409 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RhoP15409 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RhoP15409 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RhoP15409 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RhoP15409 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RhoP15409 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms