Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hoxb3P09026 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxb3P09026 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxb3P09026 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxb3P09026 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxb3P09026 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxb3P09026 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxb3P09026 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxb3P09026 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxb3P09026 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxb3P09026 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxb3P09026 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms