Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lamc1P02468 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lamc1P02468 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lamc1P02468 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lamc1P02468 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lamc1P02468 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lamc1P02468 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lamc1P02468 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lamc1P02468 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lamc1P02468 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lamc1P02468 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Lamc1P02468 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lamc1P02468 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lamc1P02468 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Lamc1P02468 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lamc1P02468 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Lamc1P02468 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lamc1P02468 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Lamc1P02468 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lamc1P02468 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lamc1P02468 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Lamc1P02468 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lamc1P02468 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Lamc1P02468 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Lamc1P02468 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lamc1P02468 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Lamc1P02468 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lamc1P02468 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lamc1P02468 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lamc1P02468 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lamc1P02468 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Lamc1P02468 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Lamc1P02468 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lamc1P02468 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lamc1P02468 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lamc1P02468 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lamc1P02468 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lamc1P02468 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lamc1P02468 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Lamc1P02468 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lamc1P02468 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lamc1P02468 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lamc1P02468 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lamc1P02468 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Lamc1P02468 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lamc1P02468 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lamc1P02468 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Lamc1P02468 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Lamc1P02468 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lamc1P02468 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lamc1P02468 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lamc1P02468 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lamc1P02468 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Lamc1P02468 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Lamc1P02468 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lamc1P02468 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lamc1P02468 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lamc1P02468 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Lamc1P02468 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lamc1P02468 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lamc1P02468 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Lamc1P02468 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
Lamc1P02468 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lamc1P02468 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lamc1P02468 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lamc1P02468 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lamc1P02468 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lamc1P02468 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lamc1P02468 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lamc1P02468 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lamc1P02468 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lamc1P02468 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lamc1P02468 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lamc1P02468 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lamc1P02468 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lamc1P02468 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lamc1P02468 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lamc1P02468 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lamc1P02468 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Lamc1P02468 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lamc1P02468 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lamc1P02468 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lamc1P02468 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lamc1P02468 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lamc1P02468 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lamc1P02468 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lamc1P02468 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lamc1P02468 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lamc1P02468 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lamc1P02468 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lamc1P02468 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lamc1P02468 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lamc1P02468 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lamc1P02468 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lamc1P02468 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lamc1P02468 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lamc1P02468 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lamc1P02468 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lamc1P02468 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lamc1P02468 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms