Protein–RNA interactions for Protein: P01725

Ig lambda-1 chain V region S178, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01725 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01725 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01725 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01725 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01725 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01725 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01725 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01725 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01725 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01725 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01725 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01725 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01725 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01725 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01725 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01725 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01725 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01725 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01725 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01725 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01725 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01725 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01725 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01725 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01725 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01725 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01725 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01725 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01725 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01725 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01725 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01725 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01725 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01725 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01725 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01725 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01725 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01725 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
P01725 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01725 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01725 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01725 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01725 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01725 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01725 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01725 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01725 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01725 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01725 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01725 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01725 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01725 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01725 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01725 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01725 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01725 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01725 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01725 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01725 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01725 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01725 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01725 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01725 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01725 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01725 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01725 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
P01725 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01725 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
P01725 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01725 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
P01725 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01725 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01725 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01725 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01725 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01725 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01725 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01725 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01725 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01725 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01725 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P01725 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01725 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01725 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01725 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01725 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01725 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01725 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01725 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P01725 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01725 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01725 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01725 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01725 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01725 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01725 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01725 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01725 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01725 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01725 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms