Protein–RNA interactions for Protein: P01101

Fos, Proto-oncogene c-Fos, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosP01101 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FosP01101 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FosP01101 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FosP01101 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FosP01101 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FosP01101 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FosP01101 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FosP01101 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FosP01101 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FosP01101 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FosP01101 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FosP01101 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FosP01101 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FosP01101 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FosP01101 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FosP01101 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FosP01101 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FosP01101 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FosP01101 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FosP01101 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FosP01101 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FosP01101 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FosP01101 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FosP01101 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FosP01101 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FosP01101 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FosP01101 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FosP01101 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FosP01101 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FosP01101 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FosP01101 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FosP01101 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FosP01101 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FosP01101 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FosP01101 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FosP01101 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FosP01101 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FosP01101 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FosP01101 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FosP01101 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FosP01101 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FosP01101 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FosP01101 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FosP01101 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FosP01101 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FosP01101 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FosP01101 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FosP01101 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FosP01101 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FosP01101 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FosP01101 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FosP01101 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FosP01101 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FosP01101 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FosP01101 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FosP01101 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FosP01101 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FosP01101 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FosP01101 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FosP01101 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FosP01101 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FosP01101 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FosP01101 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FosP01101 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FosP01101 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FosP01101 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FosP01101 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FosP01101 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FosP01101 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FosP01101 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FosP01101 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FosP01101 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FosP01101 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FosP01101 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FosP01101 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FosP01101 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FosP01101 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FosP01101 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FosP01101 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FosP01101 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FosP01101 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FosP01101 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FosP01101 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FosP01101 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FosP01101 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FosP01101 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FosP01101 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FosP01101 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FosP01101 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FosP01101 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FosP01101 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FosP01101 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FosP01101 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FosP01101 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FosP01101 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FosP01101 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FosP01101 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FosP01101 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FosP01101 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FosP01101 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms