Protein–RNA interactions for Protein: O89113

Ier5, Immediate early response gene 5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ier5O89113 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ier5O89113 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ier5O89113 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ier5O89113 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ier5O89113 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ier5O89113 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ier5O89113 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ier5O89113 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ier5O89113 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ier5O89113 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ier5O89113 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ier5O89113 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ier5O89113 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ier5O89113 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ier5O89113 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ier5O89113 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ier5O89113 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ier5O89113 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ier5O89113 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ier5O89113 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ier5O89113 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ier5O89113 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ier5O89113 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ier5O89113 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ier5O89113 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ier5O89113 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ier5O89113 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ier5O89113 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ier5O89113 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ier5O89113 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ier5O89113 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ier5O89113 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ier5O89113 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ier5O89113 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ier5O89113 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ier5O89113 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ier5O89113 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ier5O89113 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ier5O89113 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ier5O89113 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ier5O89113 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ier5O89113 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ier5O89113 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ier5O89113 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ier5O89113 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ier5O89113 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ier5O89113 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ier5O89113 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ier5O89113 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ier5O89113 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ier5O89113 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ier5O89113 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ier5O89113 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ier5O89113 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ier5O89113 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ier5O89113 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ier5O89113 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ier5O89113 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ier5O89113 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ier5O89113 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ier5O89113 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ier5O89113 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ier5O89113 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ier5O89113 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ier5O89113 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ier5O89113 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ier5O89113 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ier5O89113 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ier5O89113 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ier5O89113 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ier5O89113 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ier5O89113 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ier5O89113 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ier5O89113 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ier5O89113 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ier5O89113 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ier5O89113 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ier5O89113 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ier5O89113 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ier5O89113 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ier5O89113 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ier5O89113 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ier5O89113 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ier5O89113 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ier5O89113 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ier5O89113 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ier5O89113 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ier5O89113 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ier5O89113 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ier5O89113 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ier5O89113 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ier5O89113 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ier5O89113 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ier5O89113 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ier5O89113 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ier5O89113 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ier5O89113 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ier5O89113 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ier5O89113 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ier5O89113 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms