Protein–RNA interactions for Protein: O35744

Chil3, Chitinase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chil3O35744 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chil3O35744 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Chil3O35744 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chil3O35744 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chil3O35744 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chil3O35744 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chil3O35744 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chil3O35744 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chil3O35744 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chil3O35744 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chil3O35744 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chil3O35744 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chil3O35744 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chil3O35744 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chil3O35744 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chil3O35744 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chil3O35744 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chil3O35744 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chil3O35744 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Chil3O35744 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chil3O35744 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chil3O35744 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chil3O35744 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chil3O35744 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms