Protein–RNA interactions for Protein: O35242

Nsmaf, Protein FAN, mousemouse

Predictions only

Length 920 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmafO35242 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NsmafO35242 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NsmafO35242 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NsmafO35242 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NsmafO35242 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NsmafO35242 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NsmafO35242 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NsmafO35242 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NsmafO35242 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NsmafO35242 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NsmafO35242 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NsmafO35242 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NsmafO35242 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NsmafO35242 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NsmafO35242 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NsmafO35242 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NsmafO35242 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NsmafO35242 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NsmafO35242 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NsmafO35242 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NsmafO35242 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NsmafO35242 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NsmafO35242 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NsmafO35242 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NsmafO35242 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NsmafO35242 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NsmafO35242 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NsmafO35242 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NsmafO35242 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NsmafO35242 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NsmafO35242 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NsmafO35242 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NsmafO35242 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NsmafO35242 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NsmafO35242 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NsmafO35242 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NsmafO35242 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NsmafO35242 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NsmafO35242 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NsmafO35242 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NsmafO35242 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NsmafO35242 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NsmafO35242 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NsmafO35242 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NsmafO35242 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NsmafO35242 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NsmafO35242 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NsmafO35242 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NsmafO35242 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NsmafO35242 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NsmafO35242 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NsmafO35242 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NsmafO35242 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NsmafO35242 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NsmafO35242 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NsmafO35242 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NsmafO35242 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NsmafO35242 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NsmafO35242 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NsmafO35242 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NsmafO35242 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NsmafO35242 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NsmafO35242 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NsmafO35242 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NsmafO35242 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NsmafO35242 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NsmafO35242 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NsmafO35242 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NsmafO35242 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NsmafO35242 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NsmafO35242 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NsmafO35242 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NsmafO35242 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NsmafO35242 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NsmafO35242 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NsmafO35242 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NsmafO35242 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NsmafO35242 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NsmafO35242 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NsmafO35242 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NsmafO35242 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NsmafO35242 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NsmafO35242 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NsmafO35242 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NsmafO35242 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NsmafO35242 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NsmafO35242 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NsmafO35242 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NsmafO35242 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NsmafO35242 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NsmafO35242 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NsmafO35242 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NsmafO35242 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NsmafO35242 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NsmafO35242 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NsmafO35242 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NsmafO35242 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NsmafO35242 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NsmafO35242 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NsmafO35242 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms