Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Gm20828J3KMI7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Gm20828J3KMI7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm20828J3KMI7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Gm20828J3KMI7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Gm20828J3KMI7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Gm20828J3KMI7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20828J3KMI7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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