Protein–RNA interactions for Protein: F8VPJ6

Rfx7, Regulatory factor X, 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx7F8VPJ6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rfx7F8VPJ6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rfx7F8VPJ6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rfx7F8VPJ6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rfx7F8VPJ6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rfx7F8VPJ6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rfx7F8VPJ6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rfx7F8VPJ6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rfx7F8VPJ6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rfx7F8VPJ6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rfx7F8VPJ6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rfx7F8VPJ6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rfx7F8VPJ6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Rfx7F8VPJ6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rfx7F8VPJ6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rfx7F8VPJ6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rfx7F8VPJ6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rfx7F8VPJ6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Rfx7F8VPJ6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Rfx7F8VPJ6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rfx7F8VPJ6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rfx7F8VPJ6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rfx7F8VPJ6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rfx7F8VPJ6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rfx7F8VPJ6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rfx7F8VPJ6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Rfx7F8VPJ6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rfx7F8VPJ6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rfx7F8VPJ6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rfx7F8VPJ6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rfx7F8VPJ6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rfx7F8VPJ6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rfx7F8VPJ6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rfx7F8VPJ6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rfx7F8VPJ6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rfx7F8VPJ6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rfx7F8VPJ6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Rfx7F8VPJ6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Rfx7F8VPJ6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms