Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm8444F6XS56 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm8444F6XS56 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm8444F6XS56 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm8444F6XS56 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm8444F6XS56 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm8444F6XS56 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm8444F6XS56 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm8444F6XS56 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gm8444F6XS56 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gm8444F6XS56 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gm8444F6XS56 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm8444F6XS56 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms