Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P2

Cacna1i, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1iE9Q7P2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1iE9Q7P2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1iE9Q7P2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1iE9Q7P2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1iE9Q7P2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1iE9Q7P2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1iE9Q7P2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1iE9Q7P2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1iE9Q7P2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1iE9Q7P2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1iE9Q7P2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1iE9Q7P2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1iE9Q7P2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1iE9Q7P2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1iE9Q7P2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1iE9Q7P2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1iE9Q7P2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1iE9Q7P2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1iE9Q7P2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1iE9Q7P2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1iE9Q7P2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1iE9Q7P2 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1iE9Q7P2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1iE9Q7P2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1iE9Q7P2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1iE9Q7P2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1iE9Q7P2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1iE9Q7P2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1iE9Q7P2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1iE9Q7P2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1iE9Q7P2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1iE9Q7P2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1iE9Q7P2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1iE9Q7P2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1iE9Q7P2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1iE9Q7P2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1iE9Q7P2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1iE9Q7P2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1iE9Q7P2 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1iE9Q7P2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1iE9Q7P2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1iE9Q7P2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1iE9Q7P2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1iE9Q7P2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1iE9Q7P2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1iE9Q7P2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1iE9Q7P2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1iE9Q7P2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1iE9Q7P2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1iE9Q7P2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1iE9Q7P2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1iE9Q7P2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms