Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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