Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpv2Q9WTR1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpv2Q9WTR1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms